目前仍以手术摘除扁桃体为主要治疗方法。但要合理掌握适应症，避免任意切除扁桃体使呼吸道抗感染免疫功能低下，出现免疫监视障碍，何况手术并非绝对安全，有时还可有后遗症如咽部发干、疼痛、不适等症状。只有对于那些炎症已呈不可逆性病变时才考虑手术治疗。

根据免疫学观点，慢性扁桃体炎属“感染—变态反应状态”，且常由链球菌感染引起，故治疗不应仅限于局部用药，全身用抗生素或手术切除，还应将免疫疗法和抗变应性措施考虑在内，包括使用脱和敏作用的细菌制品（如用链球菌变应原和疫苗进行脱敏），以及各种增强免疫力的药物，如注射胎盘球蛋白、转移因子等。

慢性扁桃体炎，不仅由于炎症蔓延可引起邻近器官的感染，如中耳炎，鼻窦炎，喉、气管、支气管炎等，更重要的是为*常见的感染病灶之一，与急性肾炎、风湿性关节炎、风湿热、心脏病、长期低热等疾患关系密切。如何诊断为病灶扁桃体炎，尚缺乏特异性检查方法。

临床常认为*受扁桃体隐窝内细菌和毒素的影响，发生变态反应而产生各种并发症；此类并发症多发生于扁桃体炎发作后1～3个月，病情的演变或恶化往往与扁桃体炎的发作有联系；病灶性扁桃体以纤维型病变者居多，常有隐窝内分泌物潴留和颌下淋巴结肿大等，应根据病史、局部与全身检查等资料，全面分析，相互参证，有时结合扁桃体摘除后的情况加以判断。另外，扁桃体激发试验、血清抗链球菌溶血素“O”、抗链激酶和抗透明质酸酶滴度的动态观察等，对诊断有一定的参考意义。